La biodiversidad es uno de los temas más relevantes para ALC, así el PNUMA, a través de su Oficina Regional, ha trabajado en este tema durante mucho tiempo. El PNUMA ha estado promoviendo la asistencia técnica y creación de capacidades en los países de ALC en los temas relacionados con la conservación y utilización sostenible de la biodiversidad. El PNUMA también ha apoyado a los países en la negociación y aplicación de los AMUMA (Acuerdos multilaterales sobre medio ambiente) relacionados con la biodiversidad y los ecosistemas.

En las últimas 2 décadas, ORPALC, actuando como Secretario del Foro de Ministros de Medio Ambiente de América Latina y el Caribe, ha apoyado a los países de ALC en el desarrollo e implementación de la ILAC (Iniciativa de América Latina y el Caribe para el Desarrollo Sostenible) y los PAR (Planes de Acción Regional) - biodiversidad y los ecosistemas han sido elementos clave de la ILAC y el PAR. En el último par de años se ha prestado especial atención a apoyar a los países en la creación y gestión de áreas protegidas y en la negociación del régimen internacional sobre APB (acceso y participación en los beneficios de la utilización de los recursos genéticos). El PNUMA, a través de ORPALC, apoyó la Red Latinoamericana de Cooperación Técnica en Parques Nacionales (REDPARQUES), el Corredor Biológico Mesoamericano y varios proyectos que se han llevado a cabo con financiamiento del Fondo para el Medio Ambiente Mundial (FMAM): Proyecto de conservación  Andina Paramus, creación de capacidades para la gestión de especies invasoras en Panamá, y el proyecto de mejoramiento de sistemas de certificación para la planificación sostenible de los bosques tropicales en México y Brasil.